Postdoctoraal onderzoeker Humane Genetica bij LUMC

Nieuwe methoden ontwikkelen en toepassen voor de integratie van unieke multimodale datasets staat centraal in je werk als postdoctoraal onderzoeker bij het LUMC. Het doel is om veelbelovende aanknopingspunten en kandidaat-doelen voor neuropsychiatrische aandoeningen te identificeren. Binnen iCNS komen machine learning, computationele biologie en neurowetenschappen samen in een werkelijk interdisciplinaire samenwerking tussen verschillende instellingen.

Wat ga je doen?

Voor iCNS werken we aan een neuropsychiatrische atlas waarin klinische, genetische en neuropathologische gegevens worden gecombineerd met multimodale moleculaire metingen (bulk- en single-cell RNA-sequencing, long- en short-read sequencing, proteomics en meer). Deze unieke, veelzijdige dataset biedt volop mogelijkheden voor onderzoek. De klinische gegevens worden afkomstig uit zorgdossiers die toegankelijk zijn via Large Language Models (LLM's), niet iedere analyse is beschikbaar voor elk monster, de metingen vinden plaats op verschillende niveaus (bulk-/klinische gegevens op donorniveau versus single-cell gegevens op celniveau), en daarnaast is er een schat aan aanvullende openbare datasets beschikbaar (zoals psychENCODE, single-cell hersenatlassen en grootschalige perturbatiescreens) die kunnen worden geïntegreerd.

Het centrale thema van deze functie is multimodale en multiscale modellering van genomische gegevens bij neuropsychiatrische aandoeningen, met als doel moleculaire signaturen en kandidaat-doelen te identificeren. Daarnaast willen we nadrukkelijk ruimte bieden om de richting van het project mede vorm te geven op basis van jouw eigen interesses en expertise. Voortbouwend op eerder werk van onze onderzoeksgroep op het gebied van multi-modale en single-cell/spatiale data-integratie (zoals SpaGE, SIRV, scAGG en CPP) zijn mogelijke onderzoeksrichtingen onder andere:

• Multimodale integratie: het leren van gezamenlijke representaties over heterogene en gedeeltelijk overlappende datatypen.

• Multiscale integratie: het koppelen van bulk-/klinische gegevens aan single-cell metingen om verbanden te leggen tussen informatie op patiënt-, monster- en celniveau.

• Koppeling van patiënt- en perturbatiedata: het integreren van observationele single-cell atlassen met in-vitro perturbatiedata om kandidaat-doelen te identificeren en te prioriteren.

Wij verwachten dat de nadruk binnen deze onderzoeksrichtingen, evenals de exacte methoden die worden toegepast, gedurende het project in overleg met jou verder zal worden bepaald.

Bekijk de volledige vacature hier.

Sollicitatie deadline: 16 oktober 2026